匙吻鱘終身以浮游動物為食。仔魚開口餌料主要為小型枝角類，也吃蛋黃、魚粉、蝦粉等。仔魚孵出后雖具一定口裂，但不能閉合，只有通過不停地流動以獲得氧氣和餌料。餌料的大小應與其口裂相適應，如輪蟲。只能被動攝食，對飼料的要求順序為：輪蟲→小型枝角類→大型枝角類與橈足類。人工投餌每需投餌9至10次，每隔2小時投餌一次，每千尾魚苗每次投喂紅蟲或其它小型浮游動物3～5克。幼魚只有吻長出后才肯有主動攝食能力，攝食方式為吞食，吞食浮游動物、小魚、小蝦。當餌料不足時，鱘幼魚互相咬傷現象嚴重，須及時加大餌料投喂量和降低魚苗養殖密度。鱘魚苗體長超過12厘米以后，攝食器官發育完善，轉營濾食方式。在人工飼養下喜食浮游動物一般大小的浮性餌料。
匙吻鱘較中華鳋、達氏鰉等性成熟早，雄魚性成熟多為7～9年，雌魚多為8～10年，一般選擇18kg 左右的雌魚來催產，雌雄比一般為2∶1，匙吻鱘親魚無明顯的副性征。一般來講，雌魚個體大，腹部膨脹，尿殖口附近腫脹、充血、稍松弛，用小指頭容易插入尿殖口；雄魚個體較小、頭部有較多的突起。更可靠的方法是用肉眼觀察性腺。催產激素效果比較好的是冷凍匙吻鱘腦垂體和促黃體釋放激素類似物（LRH-A），匙吻鱘垂體使用比較普遍。一般使用劑量雌魚2個垂體/尾，雄魚1個垂體/尾。垂體解凍后加入1.5ml去離子水，碾磨后進行腹腔注射，采用一針注射法，成功率65%。用LRH-A催產也有較好的效果，劑量一般每千克體重10mg，多采用二針注射法，性腺發育較好的親魚，基本上能產空。促使親魚發情后，進行采卵、授精、脫粘、孵化，從而獲得魚苗。需要注意的是，24℃為魚苗孵化的亞致死溫度，28℃為致死溫度，而水溫低于11℃也將降低其成活率，抑制其生長。最適水溫范圍為20～24℃。另外，仔魚暫養宜在室內進行，可避免因溫差過大引起死亡。
